Протеомика как сервис (масс-спектрометрический CRO)
Масс-спектрометрическая протеомика как контрактный исследовательский сервис — глубокое DIA-профилирование протеома, таргетный MRM/PRM и аффинная протеомика для поиска биомаркеров и фармакопротеомики.
1 · Что даёт
Протеомика как сервис передаёт крупномасштабную идентификацию и количественную оценку белков специализированным контрактным исследовательским организациям (CRO), используя ЖХ-МС/МС и аффинные методы для поиска биомаркеров, фармакопротеомики и деконволюции мишеней лекарств. Регистрация данных без зависимости (DIA) теперь профилирует тысячи белков в одной пробе с высокой воспроизводимостью и без пропусков, делая глубокие протеомные карты рутинным B2B-результатом. Стек проходит от подготовки образца (переваривание SP3, iST, S-Trap) через нано-ВЭЖХ-разделение (Evosep One) и высокоразрешающую масс- спектрометрию (Orbitrap Astral, timsTOF) к биоинформатике (DIA-NN, Spectronaut, MaxQuant по базе UniProt) и статистически валидированному отчёту. Клинические лаборатории работают по аккредитации CLIA/CAP (США), ISO 17025 и GDPR ЕС для данных пациентов. Шесть организаций в этой проекции охватывают DIA-софт и сервисы (Biognosys), мощности CRO (Evotec, WuXi AppTec), аффинную протеомику (Olink, Somalogic) и подготовку образцов (ProtiFi).
Ключевые направления протеомики как сервиса:
- Глубокое DIA-профилирование протеома: тысячи белков в пробе с высокой воспроизводимостью и без пропусков (Spectronaut, DIA-NN).
- Аффинная протеомика в масштабе: платформы PEA (Olink) и аптамерная (SomaScan) для высокоплексного профилирования плазмы без масс-спектрометрии.
- Фармакопротеомика и деконволюция мишеней: LiP-MS и анализ белков- хозяев для изучения механизмов действия лекарств.
- Высокопроизводительная подготовка образцов: стандартизация S-Trap и Evosep One для снижения межпрогонной вариативности.
Отраслевая цепочка создания стоимости#
[подготовка образца] ──> [обессоливание] ──> [ВЭЖХ-разделение] ──> [регистрация на МС]
│
(биоинформатика)
│
▼
[B2B-отчёт] <─── [статистика] <─────┘
Уровни цепочки создания стоимости#
| Уровень | Описание | Ключевые входы/выходы |
|---|---|---|
| Подготовка образца | лизис, восстановление/алкилирование, трипсинолиз | Вход: плазма, ткань. Выход: пептиды. |
| Обессоливание и фракционирование | очистка на C18 StageTip | Вход: пептиды. Выход: чистая пептидная смесь. |
| ВЭЖХ-разделение | градиент нано-ВЭЖХ / Evosep One | Вход: пептидная смесь. Выход: разделённые пептиды. |
| Регистрация на МС | Orbitrap Astral / timsTOF, режим DIA или DDA | Вход: пептиды. Выход: сырые спектры. |
| Биоинформатика | DIA-NN / Spectronaut / MaxQuant по UniProt, FDR <1% | Вход: спектры. Выход: количественная оценка белков. |
| Статистика и отчётность | volcano plots, KEGG/Reactome, B2B-отчёт | Вход: количественные данные. Выход: дифференциальный отчёт. |
Сквозные технологии сектора:
- mass-spectrometry: высокоразрешающая ЖХ-МС/МС (Orbitrap Astral, timsTOF) с регистрацией DIA.
- dia-proteomics: DIA без библиотек с нейросетевой деконволюцией (DIA-NN, Spectronaut).
- affinity-proteomics: платформы PEA и аптамерная для высокоплексной протеомики плазмы.
2 · Что заменяет 3
3 · Как внедрить 6 шагов
- 1Подготовка образцаИспытания и аналитикаРецептура и смешиваниеПробы плазмы или ткани принимаются и проверяются на гемолиз, затем лизируются в денатурирующем буфере для полного солюбилизации белкового содержимого.Кто может выполнить этот шаг подобраны автоматическиIndia Glycols (NSE) Индия✓ GMP 7,500 MT/ промышленный масштаб“Recent expansions and new facilities across процесses: MEG production growth (up to 200,000 MTPA), EO purification, ethoxylate, sulphation, formulation plants, and …”✓ GMP промышленный масштаб“ProBio: A global CRDMO (contract research, development, and manufacturing organization) providing end-to-end solutions for biologics and cell and gene therapy (CGT).”Esco Aster Сингапур5,000 L промышленный масштаб“Esco Aster (Singapore) is a cGMP contract research, development and manufacturing organization (CRDMO/CDMO) and bioinnovation venture accelerator that helps clients and …”✓ GMP 500 m3“This is a satellite blending, mixing and formulation facility, located at Vashind near Shahapur and dedicated to the company’s Animal Nutrition business.”SyAqua Group Таиланд“vannamei genetics (broodstock, nauplii, and post-larvae) built on genomic selection/marker-assisted selection plus quantitative genetics (BLUP), with disease resistance screening …”“In 2025-2026, it reports commissioning/stabilising Kakinada phosphoric and sulphuric acid plants (backward integration), brownfield granulation expansion progressing for completion …”
- 2ПеревариваниеБиогаз, компост и переработка отходовДисульфидные связи восстанавливаются и алкилируются, а секвенирующий трипсин расщепляет белки на пептиды оптимальной длины и заряда для масс-спектрометрии.Кто может выполнить этот шаг подобраны автоматически✓ ISO 17025“Les activités de recherche visent l’exploitation des connaissances dans le domaine des biotechnologies végétales pour contribuer au développement du secteur oléicole national à …”163,050 tonnes“China Everbright Environment Group Limited (257.HK) is a flagship China Everbright Group industrial company focused on solid waste (waste-to-energy and synergistic treatment), …”SupaZorb ЮАР240L промышленный масштаб“SupaZorb is committed to developing eco-friendly, cost-effective absorbents that not only clean up environmental pollutants but convert them into usable biomass and compost.”Red Diamond Compost Барбадос“Provided through four main products; compost, worm castings, biochar and organic biologic fertilizers.”CRUST Group Сингапур50,000L“Through our B2B Valorisation as a Service (VaaS) model and our proprietary brands, CRUST and CROP, we aim to collaborate with F&B chains, retailers, and hospitality partners to …”Taiwan Sugar Corporation (TSC) Тайвань500,000 tons пилотный масштаб“It refines sugar (including refined white sugar, golden brown sugar, fine granulated sugar and invert sugar syrup), produces bio-based chemicals/biotech outputs (alcohol, …”
- 3ОбессоливаниеПептиды очищаются на C18 StageTips от солей и буферов, подавляющих ионизацию, затем высушиваются и реконструируются в растворителе для ввода.
- 4Регистрация ЖХ-МС/МСИспытания и аналитикаПептиды разделяются нано-ВЭЖХ и измеряются в режиме DIA на высокоразрешающем приборе Orbitrap или timsTOF с периодическими QC-инъекциями для контроля стабильности.Кто может выполнить этот шаг подобраны автоматически✓ GMP промышленный масштаб“ProBio: A global CRDMO (contract research, development, and manufacturing organization) providing end-to-end solutions for biologics and cell and gene therapy (CGT).”Esco Aster Сингапур5,000 L промышленный масштаб“Esco Aster (Singapore) is a cGMP contract research, development and manufacturing organization (CRDMO/CDMO) and bioinnovation venture accelerator that helps clients and …”Turion Labs Сингапур“Turion Labs is a Singapore-headquartered biotech innovation platform that provides shared laboratory infrastructure, contract research organization (CRO) services, and regulatory …”Biotrend SA Португалия250L промышленный масштаб“At Biotrend we put our know-how and resources to the service of our clients by providing contract research and development services and we develop in-house research programs to …”FastBio Бразилия“Com forte networking e com parcerias estabelecidas junto as principais Contract Research Organizations (CROs), a FastBio disponibiliza um portfolio de serviços biológicos …”BRAIN Biotech Германияпромышленный масштаб“As a contract research organization (CRO), we provide smart, rapid, and effective solutions using cutting-edge technologies to drive customer success.”
- 5БиоинформатикаСырые спектры обрабатываются в DIA-NN или Spectronaut по базе FASTA UniProt с идентификацией и количественной оценкой белков при частоте ложных открытий ниже 1%.
- 6Статистика и отчётностьРассчитывается дифференциальная экспрессия (volcano plots, ANOVA), картируются обогащённые пути (KEGG, Reactome), и валидированный B2B-отчёт доставляется в LIMS-портал клиента.
4 · Кто поставит
Подобранные поставщики (подобраны автоматически)
| Aristogene Biosciences Pvt. Ltd. | Индия | Производитель | работает |
| Turion Labs | Сингапур | Наука / R&D | работает |
| BRAIN Biotech | Германия | Производитель | работает |
| BedoukianBio | США | Производитель | работает |
| SyncoZymes (Shanghai) | Китай | Производитель | работает |
| N.Thing | Южная Корея | Наука / R&D | работает |
| ENZUR S.A. | Уругвай | Производитель | работает |
| MGI (BGI Group) | Китай | Производитель | работает |
| FastBio | Бразилия | Производитель | работает |
| Equinom | Израиль | Не определена | работает |
| Unibio | Дания | Производитель | работает |
| Tapera Industries Limited | Замбия | Производитель | работает |
Ведущие компании и институты (из обзора)
| Компания / Институт | Страна | Ключевые продукты / платформы | Технологические особенности | Status 2026 |
|---|---|---|---|---|
| Biognosys | 🇨🇭 Швейцария | Spectronaut, TrueDiscovery | золотой стандарт DIA-софта, timsTOF | commercial |
| Evotec | 🇩🇪 Германия | CRO высокопроизводительной протеомики | Orbitrap Astral, деконволюция мишеней | commercial |
| WuXi AppTec | 🇨🇳 КНР | CRO биомаркерной протеомики | Orbitrap Eclipse + Q-TOF (SSE 603259) | commercial |
| Olink Proteomics | 🇸🇪 Швеция | PEA-панели (Signature Q100) | proximity extension assay, NGS-считывание | commercial |
| Somalogic | 🇺🇸 США | SomaScan Select 4K | аптамерная аффинность, ~4 000 белков | commercial |
| ProtiFi | 🇺🇸 США | Подготовка образцов S-Trap | стандартизованное переваривание, низкий CV | commercial |
5 · Правила и путь на рынок
155–235 рабочих дней по правилам ЕАЭС (плюс досье); национальный путь по 61-ФЗ открыт до 31.12.2027
Информация, не юридическая консультация — уточните процедуру для вашего продукта. (2026-10-06)
США
США лидируют по аффинно-протеомным платформам и клинически аккредитованным CRO-сервисам, тесно интегрированным с разработкой лекарств.
аффинные платформы, клиническая аккредитация, подготовка образцов#
- Somalogic (Standard BioTools): аптамерная платформа SomaScan; её анализ SomaScan Select 4K количественно оценивает около 4 000 белков из небольшой пробы плазмы.
- Olink Proteomics (Thermo Fisher): панели Proximity Extension Assay (PEA) со считыванием ПЦР/NGS на приборе Olink Signature Q100 для высокоспецифичной протеомики плазмы.
- ProtiFi: технология подготовки образцов S-Trap (включая 96-луночные планшеты), стандартизирующая переваривание и снижающая межпрогонную вариативность.
- Аккредитация CLIA/CAP: американские лаборатории, выполняющие диагностическую протеомику, обязаны соответствовать стандартам CLIA и College of American Pathologists.
Евросоюз
Европейский союз лидирует по DIA-софту, премиальным фармакопротеомным CRO и международным органам стандартов в условиях жёсткого управления данными GDPR.
лидерство в DIA-софте, фармакопротеомика, GDPR#
- Biognosys (Шлиерен, Швейцария; Bruker): ПО DIA-анализа Spectronaut (золотой стандарт отрасли; Spectronaut 21 и SpectroMine 6 представлены на ASMS 2026), а также сервисы глубокого профилирования TrueDiscovery на timsTOF.
- Evotec (Германия): высокопроизводительная протеомика на Orbitrap Astral, включая количественный анализ белков-хозяев антительных терапевтических препаратов и идентификацию мишеней.
- Стандарты HUPO и GDPR: Human Proteome Organization задаёт международные правила валидации, тогда как CRO ЕС ведут мультиомиксные платформы (пространственная транскриптомика плюс пространственная протеомика) в условиях жёсткого управления данными пациентов.
Китай
Китай рассматривает протеомику как стратегическую национальную дисциплину и ведёт крупнейшее в мире наращивание мощностей для глубокого картирования протеома.
национальные центры, конкурентные по цене CRO, локализация приборов#
- CNPHen (Национальный центр прецизионной медицины, Пекин/Шанхай): гигантские протеомные центры с десятками приборов последнего поколения Orbitrap Astral и timsTOF Ultra в круглосуточном режиме.
- WuXi AppTec (SSE 603259) и BGI Proteomics: предлагают глубокое профилирование протеома плазмы и тканей для поиска биомаркеров и доклиники, делая Китай конкурентным по цене глобальным хабом аутсорсинга.
- Локализация приборов: отечественные нано-ВЭЖХ-системы и кастомные сорбенты колонок для снижения зависимости от импортных расходных материалов.
6 · Финансирование: тендеры и гранты
| Грант | DEVCOM Army Research Laboratory: широкое объявление о фундаментальных исследованиях Dept of the Army -- Materiel Command · США | 20 нояб. 2027 г. 409 дн. |
| Грант | FY26: оборонная программа стимулирования конкурентных исследований (DEPSCoR) — исследовательское … Air Force Office of Scientific Research · США | 5 апр. 2027 г. 180 дн. |
| Грант | Министерство обороны США, Defense Health Agency (DHA): широкое объявление об исследованиях и разработках … Defense Health Agency Contracting Activity - DHACA · США | 30 сент. 2027 г. 358 дн. |
| Грант | CHIPS Research and Development Office (CRDO): широкое объявление об исследованиях (BAA) National Institute of Standards and Technology · США | 30 сент. 2029 г. 1089 дн. |
| Грант | NIGMS: институциональная программа подготовки студентов бакалавриата к биомедицинским исследованиям (BURT, … National Institutes of Health · США | 25 сент. 2028 г. 719 дн. |
7 · Технологический стек
Стек объединяет хроматографию, высокоразрешающую масс-спектрометрию и нейросетевую биоинформатику, дополненную аффинной протеомикой.
- Нано-ВЭЖХ и высокоразрешающая МС:
- Evosep One нано-ВЭЖХ разделяет пептиды на колонках C18, питая Orbitrap Astral (высокоскоростная регистрация) или Bruker timsTOF (разделения по захваченной ионной подвижности) в режиме DIA или DDA.
- Регистрация DIA и биоинформатика:
- DIA без библиотек деконволируется нейросетевым ПО (DIA-NN) и Spectronaut от Biognosys, а MaxQuant ведёт бесклеевую количественную оценку DDA по UniProt при контроле FDR ниже 1% на уровне пептида и белка.
- Аффинная протеомика:
- PEA от Olink (двойное антительное узнавание со считыванием ПЦР/NGS) и SomaScan от Somalogic (аптамеры с медленным отсоединением) количественно оценивают тысячи белков плазмы без масс-спектрометрии, расширяя доступ к высокоплексной протеомике.
Источники 32
- Biognosys — 2026-05-31T00:00:00.000Z
- Biognosys — 2026-06-11T00:00:00.000Z
- Biognosys — 2024-05-30T00:00:00.000Z
- Biognosys — 2026-06-03T00:00:00.000Z
- Evotec — 2026-01-12T00:00:00.000Z
- Evotec — 2024-08-20T00:00:00.000Z
- Evotec — 2026-02-09T00:00:00.000Z
- Evotec — 2024-07-31T00:00:00.000Z
- Evotec — 2025-01-16T00:00:00.000Z
- Wuxi apptec — 2026-06-30
- Wuxi apptec — 2026-06-30
- Wuxi apptec — 2026-06-30
- Wuxi apptec — 2026-06-30
- Wuxi apptec — 2026-06-30
- Wuxi apptec — 2026-06-30
- Wuxi apptec — 2026-06-30
- Wuxi apptec — 2026-06-30
- Olink — 2025-01-01T00:00:00.000Z
- Olink — 2026-04-29T00:00:00.000Z
- Olink — 2026-04-09T00:00:00.000Z
- Olink — 2025-01-27T00:00:00.000Z
- Olink — 2025-09-21T00:00:00.000Z
- Somalogic — 2025-04-25T00:00:00.000Z
- Somalogic — 2026-02-24T00:00:00.000Z
- Somalogic — 2024-08-27T00:00:00.000Z
- Somalogic — 2024-12-06T00:00:00.000Z
- Somalogic — 2026-02-24T00:00:00.000Z
- Protifi — 2025-12-10T00:00:00.000Z
- Protifi — 2025-12-10T00:00:00.000Z
- Protifi — 2026-04-14T00:00:00.000Z
- Protifi — 2025-12-10T00:00:00.000Z
- Protifi — 2025-12-10T00:00:00.000Z